Clark被Zod流放到Jol-El設(shè)計(jì)的監(jiān)獄“Phantom Zone”，遇到了Jol-El的助手Raya。Raya將Jol-El留給自己刻有S標(biāo)志的水晶石交給Clark，并告訴Clark當(dāng)初Jol-El設(shè)計(jì)監(jiān)獄的時(shí)候因擔(dān)心會(huì)有El家族的人被關(guān)進(jìn)監(jiān)獄，專門遺留了后門，只有El家族的人才可以打開。在Raya的幫助下，Clark通過后門離開了監(jiān)獄，但也將監(jiān)獄里的幾個(gè)罪犯帶到了地球。Martha從墜毀的飛機(jī)里醒來，發(fā)現(xiàn)自己和Lois來到了北極Jol-El的堡壘。在堡壘里，Jol-El告訴Martha，因?yàn)镃lark沒有殺死Zod的肉體Lex，導(dǎo)致Zod將病毒釋放到地球。Martha答應(yīng)Jol-El代替Clark殺死Lex，而Jol-El承認(rèn)自己對(duì)Clark的教育是失敗的。 在大都會(huì)，Lionel Luthor從暴民手里救走了Chloe，把Chloe留在星期日?qǐng)?bào)后Lionel試圖到Kent農(nóng)場取回Clark飛船里的鑰匙，試圖用鑰匙制服Zod，恰好遇到從北極返回的Martha。Chloe躲在辦公桌下試圖通過自己收集的資料尋找Zod的弱點(diǎn)，遇到了自己中學(xué)時(shí)代實(shí)習(xí)時(shí)的“小朋友”Jimmy Olsen。 與此同時(shí)，Zod將Lana帶到Lex的城堡，試圖利用Lex的電腦控制五角大樓的衛(wèi)星，將地球改造成自己的Krypton。Lana意識(shí)到Zod控制了Lex的身體，試圖阻止Zod，不料Zod殘忍地用利劍刺透手掌釘在了墻上。Lana強(qiáng)忍傷痛來到Kent農(nóng)場，將當(dāng)是Clark和Chloe試圖殺死Lex的事情告訴Martha和Lionel，并接過Martha從Jol-El堡壘帶回的匕首。 在衛(wèi)星的作用下，大都會(huì)和Smallville陷入地震，正當(dāng)Martha和Lionel遭遇危機(jī)的時(shí)候，Clark即時(shí)趕來。Martha將Zod的行蹤告訴Clark，Clark急忙向Lex的城堡趕去。Lana假裝和Zod親近，試圖趁機(jī)刺殺Zod，不料被Zod識(shí)破。千鈞一發(fā)之際Clark趕來和Zod發(fā)生大都。Zod試圖控制Clark，而Clark運(yùn)用智慧將Raya交給自己的水晶放到Zod手掌，將Zod逼離Lex的軀體。 在Smallville的醫(yī)院，Clark看望蘇醒過來的Lois，兩人的手握在了一起。Clark來到星期日?qǐng)?bào)后看到了Chloe的朋友Jimmy，內(nèi)心感到失落。回到Kent農(nóng)場，Clark將自己的感受告訴Martha，Martha安慰Clark只要按照自己的想法去做，就會(huì)做出正確地選擇。Clark開始思考自己未來的角色。