超能星學園劇情講述了統領十二星座的方氏一族成為了世界上最強大的家族，然而方氏一族的族長方默存一家卻遭遇到了前所未有的繼任危機。方默存病危，方太太為了維護家族的利益醞釀了一場驚天動地的陰謀， 派人追殺方默存獅子座的私生子，用自己早產的雙子座兒子方天澤取而代之，從而引發的一場奇幻故事。　　統領十二星座的方氏一族成為了世界上最強大的家族，然而方氏一族的族長方默存一家卻遭遇到了前所未有的繼任危機。方默存病危，方太太為了維護家族的利益醞釀了一場驚天動地的陰謀，派人追殺方默存獅子座的私生子，用自己早產的雙子座兒子方天澤取而代之。　　十八年后，方天擇(肖戰 飾)成為了“超能星學園”最大社團的會長，與第二大社團會長天秤座李亞當(彭楚粵 飾)水火不容。而新轉來的特招生程芝兒因為得罪了李亞當在學校受人欺負，又因與方天擇糾纏不清的關系受到愛慕方天擇的霍貝貝陷害。幸好遇到了獅子座暖男萬適存(白澍 飾)，他為了保護程芝兒和她一起參加了“超能之星”大賽，然而程芝兒卻在這場大賽中與方天擇產生了感情。失落的萬適存在“超能之星”總決賽中展現出驚人的實力，用盡一切手段逼迫方天擇使出雙子座的超能力，然而方天擇卻出乎意料的用出了獅子座的超能力，這讓萬適存大為震驚。他故意輸掉比賽，讓方天擇奪得榮譽順理成章的繼承族長之位。超能星學院劇照　　賽后，一個神秘人找到萬適存提出要和他共同對付方天擇，被萬適存拒絕，他要親自打倒方天擇來證明自己。繼任典禮當天，萬適存綁架程芝兒迫使方天擇已使出雙子座分身的超能力，整個方氏一族親眼目睹了方天擇暴露身份的事實。萬適存現身揭露了十八年前方母的陰謀，宣稱自己才是真正的獅子座，是方氏財團真正的繼承人。方母鋃鐺入獄，方天擇被逐出方家，萬適存成為了方氏一族的族長、十二大家族的首領。　　萬適存對方氏財團進行了大規模的清洗和改革，卻不幸讓蟄伏已久的蛇夫族人趁虛而入。蛇夫族人將萬適存重創，并且將魔爪滲透到超能星學園，所幸被校長和方天擇識破并且揪出了潛伏在學園已久的內奸。蛇夫傾巢而出，對超能星學園發動了毀滅性的攻擊。為了守護十二星座家族，方天擇與萬適存拼盡全力聯手抵抗，卻為時已晚;萬適存最終選擇了犧牲自己終于壓制住了蛇夫族，然而這批蛇夫族人只是整個蛇夫座的先鋒部隊，真正的主力部隊在終極反派的帶領下襲來，就在所有人都束手無策坐以待斃的時候，最平凡的程芝兒突然覺醒了自己的超能力。