紐約布魯克林區，一個陽光明媚的中午，一個看起來很怪異的光頭坐在一處建筑工地對面的小餐館里，點了一份很怪異的午餐（在三明治中添加了11個辛辣無比的塔巴斯科辣椒），然后在記事本上寫著一串又一串很怪異的字符。他還不時用一部很怪異的望遠鏡查看工地上的施工情況。突然，建筑工地上發生了劇烈爆炸，一臺吊車砸向旁邊的建筑，四周塵土飛揚，人們四散逃命。光頭卻很從容地走向爆炸現場，掏出 "手機" 通知某人："它抵達了。"　　凌晨，Walter一直在床上默默背誦無醇飲料的配方，睡不著的Peter又煩又氣。Peter再次向Olivia表達了退出 "調查小組" 的想法－－因為他的作用僅僅是一個保姆，他對于調查 "The Pattern" 沒有任何幫助。他說得也許沒錯，但Walter也明確告訴過Olivia：如果Peter退出，他也會退出。Peter有些無可奈何。　　Broyles把 "三人小組" 召集到爆炸現場。官方鑒定結論為：爆炸是由煤氣泄漏引起的－－這并沒有錯。問題是，什么東西導致了煤氣管道的破裂？調查人員在現場發現了一個60厘米高、外形很像子彈的容器。這種東西并非第一次出現－－1987年，這東西曾出現在某軍事基地附近。Walter要求Broyles想一切辦法將這東西轉運到自己的實驗室（哈佛大學）。　　Olivia前去拜訪一位老朋友－－此人曾于1987年參與了對該柱體的調查工作。調查中他們發現，柱體在一定的頻率下會產生振動，可能是在向外傳送某種信息。但是沒等他們開展進一步的研究，柱體從實驗室掉落到地下室，引起一場爆炸，然后就消失了。20年來，再沒有人見過它。　　正當Walter在自己的實驗室里研究柱體的時候，一個面色陰沉的人帶著一把威力巨大的脈沖槍來到紐約市某倉庫尋找這個柱體。　　入夜，Olivia被一陣電話鈴聲吵醒，是已死的John Scott！當Olivia反查電話來源時，卻發現自己的手機三個小時內都未曾接到過電話。　　Walter告訴Peter，自己曾替軍方研究過雷神計劃，這種武器可以射穿地球核心，攻擊地球另一端（或者任意一個地點）的目標。此時，細心的Olivia在1987年柱體爆炸現場的資料圖片上認出了那個神秘的光頭－－此人在第一集中曾出現在John Scott所在的醫院里。Olivia立刻將此發現告訴Broyles。Broyles什么也沒說，把Olivia帶進秘密資料室。墻上掛滿了此人的資料照片－－原來，FBI已經關注此人很久了，在超過36起與 "The Pattern" 相關的災難中，此人都曾到過現場。FBI將此人稱作 "觀察者"，因為他似乎什么也不做，只是在一旁靜靜地觀察事情的發生。　　Olivia打電話將倉庫遇襲的事通知Peter，但Walter的第一反應卻是要Peter替他找鋁箔來。Walter給出的解釋是：鋁箔能阻斷柱體向外傳送信號。這聽起來似乎很有道理，Peter于是立即動身去找。Peter剛剛離開，Walter就用麻醉針弄暈了Astrid。等Peter回來的時候，Walter和柱體都不見了。 與此同時，Walter在一餐廳一邊喝著心儀的無醇飲料，一邊與那名光頭會談。光頭感謝Walter替他藏起了 "信標"，并稱Walter心中所有的疑問不久就能得到解答。隨后，Walter故意被警方發現，回到了FBI總部，但他始終不肯透露柱體的去向。Walter說，為了不讓柱體落入壞人之手，必須將它再藏四個小時。　　Peter對父親的固執和不可理喻感到徹底失望，他怒氣沖沖地回到地下實驗室收拾行裝，準備另找工作。但他不知道的是，拿脈沖槍的家伙一直在暗處等著他……這家伙將Peter綁架到某個密室，給他鼻子里塞上很長的電線，并用很強的電流刺激他的大腦，試圖找出柱體的下落。　　Olivia發現Peter被綁架后，立即向Walter求助。但是Walter覺得為時已晚－－盡管Peter什么都不知道，但壞人依然可以從他那里獲知柱體的位置。這家伙帶著Peter來到墳場，命令他挖開祖父的墳墓。柱體果然就藏在這里。正在此時，Olivia駕車趕到，最終，這家伙被Olivia擊斃。當Olivia檢查尸體的時候，掉在地上的柱體突然鉆進地表深處，不見了蹤影。　　一直在樹林里觀察整件事的光頭掏出 "手機" 通知某人："（東西）已經按時離開了。" Peter從背后將光頭撲倒在地，要求他說出柱體的秘密。但光頭作出了非常驚人的舉動：他開始重復Peter所說的每一句話，甚至包括Peter剛剛想到還沒來得及說出口的話。光頭所說的最后一句話是："你認識我父親嗎？" 不知道這是光頭說自己，還是說Peter。隨后，光頭取出一支脈沖槍將Peter擊暈。　　Olivia到醫院接Peter出院的時候遇到Broyles，Broyles告訴她柱體已經找不到了。神情沮喪的Peter依然沒能從昨晚的驚嚇中回過神來。他感覺Walter有很重要的事情在瞞著他－－除非他弄清真相，否則他不會再輕言退出。Olivia笑了，伸手遞給他一張正式的證件－－Peter現在的身份是國土安全部的平民顧問。　　Peter問Walter：別人怎么能通過自己的大腦獲得Walter才知道的信息？Walter說，兩個人越親近，信息的滲透性就越強－－這種過程可能并不來源于普通的交流，而是潛移默化的。Walter還說了個故事－－原來，光頭對他們父子有救命之恩。當光頭救他的時候，他感覺光頭似乎進入了他的大腦，遍歷了所有的記憶。光頭要Walter日后報答他，Walter不明白這話是什么意思，直到那個柱體出現在他眼前－－他的大腦中就像出現了一本說明書一樣。　　生平第一次，Peter感覺父親的確在說真話。　　忙碌了一整天的Olivia回到家里……突然！已經死去的John Scott出現在她的眼前！還主動向她打招呼！