艾達被殺菲茲悲傷局外再次有玄機

艾達殺掉了內森特特工，并創造了一個一模一樣的機器人取代了梅，大家都沒有察覺梅的異常。

局長從大局考慮，也為了徹底銷毀《黑暗之書》，他召集大家去銷毀艾達的硬盤，機器人梅不動聲色，博士和菲茲則惋惜不已，邁克言辭激烈地提醒他們，艾達只是一個機器人，如果放任自由，最終會傷害人類。博士和菲茲只好奉命去找艾達，沒想到艾達已經升級并修改了程序，博士無法強制關機，艾達知道大家的來意，她出手打傷了隨行特工然后逃走。

納迪爾議員的弟弟維杰被西蒙斯從繭里解救出來后，就被納迪爾議員帶到父親死前設計的最后一棟房子處，納迪爾一直追問維杰在沉睡的七個月里發生了什么，維杰說自己只是陷入長時間的孤獨和黑暗中，他很感謝西蒙斯救出了他，可是納迪爾議員不愿聽到維杰對神盾局的認可。

原來奇瑞塔人曾經殺了納迪爾議員和維杰的母親，因此納迪爾議員憎恨異人族，他們曾經發誓，如果家族中有人變異，其他人則會殺了對方，所以納迪爾議員聯系了督查者來消滅維杰，維杰對著姐姐苦苦應求，因為自己沒有獲得任何異能，納迪爾議員最終被打動，讓督察者放了維杰，督察者質疑納迪爾議員有意偏袒異能人。

因為局長在媒體面前說黛西拯救了城市，因此媒體鋪天蓋地地贊揚黛西。局長從黛西處得知西蒙斯已經調查出維杰的身份，局長害怕納迪爾議員傷害維杰，他帶著黛西和西蒙斯去解救維杰。西蒙斯襲擊了納迪爾議員辦公室的助理，通過手機定位找到了納迪爾議員，神盾局正在和納迪爾議員談判，督察者趁機想去殺了維杰，關鍵時刻，維杰的異能被激發，他躲開了督察者的攻擊。

西蒙斯動員維杰和他們回到神盾局，但是納迪爾議員用親情打動了維杰，維杰跟著姐姐一起坐上了迎接他們的飛機，沒想到納迪爾議員利用維杰的信任親手開槍打死了維杰，督察者再也沒有理由質疑納迪爾議員。

另外一邊，邁克去接悠悠球加入行動，但是當他們準備回去的時候，發現飛機被艾達控制主動攻擊他們。菲茲和博士去啟動未聯網服務器，菲茲認為是《黑暗之書》讓艾達擁有了人類的情緒和自由意識，因此艾達才在情緒的驅使下傷害特工，博士很自責，認為這一切都只是因為自己創造了艾達。艾達斷開了基地的電源并黑入了基地，她打暈了企圖阻止她的菲爾，通過控制機器人梅找到了菲爾藏在局長辦公室的《黑暗之書》，菲爾絲毫沒有留意到梅只是一個機器人。

艾達在局長辦公室找到了《黑暗之書》準備離開，在基地門口，她被趕回來的邁克用斧子一下砍掉了頭，菲茲對艾達的死趕到很抱歉。

基地里，大家都松了一口氣，以為解決了艾達，但是沒有想到另外一邊，博士正和另外一個艾達喝酒，原來，這一切都是博士的計劃，他想自己得到《黑暗之書》，但是艾達失敗了，他啟動了對機器人梅的控制。

督察者把維杰扔進了大海，維杰再次變成了繭狀。